Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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ChfrQ810L3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ChfrQ810L3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ChfrQ810L3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ChfrQ810L3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ChfrQ810L3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChfrQ810L3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ChfrQ810L3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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