Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms