Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ntf4Q80VU4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms