Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms