Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
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