Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo1Q7TT28 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms