Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

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Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sgo2Q7TSY8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sgo2Q7TSY8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sgo2Q7TSY8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sgo2Q7TSY8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sgo2Q7TSY8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sgo2Q7TSY8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sgo2Q7TSY8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sgo2Q7TSY8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms