Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube2q1Q7TSS2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube2q1Q7TSS2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube2q1Q7TSS2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube2q1Q7TSS2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms