Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PhkbQ7TSH2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PhkbQ7TSH2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms