Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdp1Q7TSG2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms