Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Raver2Q7TPD6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Raver2Q7TPD6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms