Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdcl2Q78Y63 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms