Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1cQ76I25 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1cQ76I25 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms