Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms