Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynmQ70IV5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynmQ70IV5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms