Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms