Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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