Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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