Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcl3Q6W5C0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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