Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms