Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc154Q6RUT8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms