Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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