Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtifQ6PEE2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms