Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms