Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sarm1Q6PDS3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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