Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms