Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbtb40Q6PCS8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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