Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac10Q6P3E7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms