Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casc4Q6P2L7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc4Q6P2L7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casc4Q6P2L7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms