Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms