Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpbp1l1Q6NZP2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms