Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms