Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc3bQ6NWW9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms