Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc66Q6NS45 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc66Q6NS45 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms