Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms