Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms