Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop58Q6DFW4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms