Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cep290Q6A078 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cep290Q6A078 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cep290Q6A078 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Cep290Q6A078 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Cep290Q6A078 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cep290Q6A078 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cep290Q6A078 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cep290Q6A078 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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