Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Swap70Q6A028 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Swap70Q6A028 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms