Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Arhgef39Q66JY6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms