Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q66JV7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q66JV7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q66JV7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q66JV7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q66JV7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q66JV7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q66JV7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms