Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VclQ64727 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VclQ64727 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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VclQ64727 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VclQ64727 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VclQ64727 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VclQ64727 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VclQ64727 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VclQ64727 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VclQ64727 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VclQ64727 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
VclQ64727 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VclQ64727 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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VclQ64727 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VclQ64727 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VclQ64727 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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VclQ64727 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VclQ64727 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VclQ64727 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VclQ64727 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VclQ64727 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VclQ64727 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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