Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ptpn13Q64512 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms