Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim24Q64127 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms