Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms