Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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