Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sall3Q62255 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall3Q62255 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms