Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six3Q62233 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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