Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ttf1Q62187 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ttf1Q62187 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ttf1Q62187 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ttf1Q62187 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttf1Q62187 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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