Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssr4Q62186 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ssr4Q62186 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ssr4Q62186 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssr4Q62186 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ssr4Q62186 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssr4Q62186 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssr4Q62186 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssr4Q62186 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssr4Q62186 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssr4Q62186 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms